Parte integrante del Museo è una raccolta di materiale scientifico, non visibile al pubblico poiché ad esclusivo uso di ricerca e didattica, consistente in una collezione di feti umani ottenuti durante le varie fasi di sviluppo e conservati sia come campioni disidratati che in fissativi aldeidici.
Al fine di rendere fruibile il valore scientifico e didattico di questa collezione a tutti gli studenti dell'Università di Parma e agli studiosi italiani e stranieri che ne se ne vogliano servire, la Direzione Scientifica, coadiuvata dagli studenti del Corso Opzionale di Neurosecrezione Ipotalamica della Facoltà di Medicina e Chirurgia, ha iniziato un progetto, denominato "ORGANOGENESIS", per allestire e mettere in rete un atlante ipertestuale di morfologia e anatomia regionale dello sviluppo umano, a partire dalla raccolta museale e da materiale bibliografico storico inerente l'embrione umano, conservato nella Libreria del Dipartimento.
Esempi di ORGANOGENESIS sono l'ipertesto 1, cortesia di Davide Malinconico, Elena Borghi e Francesco Saggese, che mostra l'anatomia in sezione sagittale paramediana dell'embrione umano allo stadio Carnegie 11 e l'ipertesto 2, che presenta una dissezione dell'encefalo e della ghiandola ipofisi in un feto al 5° - 6° mese di gestazione.